En plus des directions centrales, les services extérieurs, érigés en Pôles Régionaux de Recherche et de Développement Agricoles (PRRDA) et centres régionaux, constituent les relais régionaux qui permettent à l'Institution, d'opérer un rayonnement de la recherche agricole dans le milieu agricole, au niveau de la circonscription territoriale de chaque pôle et centre.

Deux PRRDA et quatre centres régionaux couvrent l'ensemble du territoire du pays selon un découpage territorial, basé sur un critère pédo-climatique, se présentant comme suit :

-Centre Régional de Recherche en Agriculture Oasienne de Degueche (Tozeur)

- Centre Régional de Recherche en Horticulture et Agriculture Biologique de Chott Mariem ( Sousse)

-          - Centre régional des recherches agricoles ( Sidi Bouzid)

- Centre régional des recherches en grandes cultures (Béja) 

- PRRDA du Nord Est (Mornag)

- PRRDA du Nord Ouest semi-aride ( Le Kef)