La Sous Direction de la Coopération Internationale est chargée de la coordination et de la supervision des programmes de coopération scientifique bilatérale et multilatérale de l'Institution de la Recherche et de l'Enseignement Supérieur Agricoles et des établissements qui en relèvent.
L'IRESA entretient des liens bilatéraux importants avec les pays de l'UMA (le Maroc l'Algérie, la Libye et la Mauritanie), l'Egypte, la Jordanie, la Syrie, l'Arabie Saoudite, qu'avec la France, l'Italie, l'Allemagne, la Belgique, la Suède, l'Espagne, le Portugal, la Grèce, La Hollande, la Suisse, la Turquie, les Etats Unis d'Amérique,le Canada le Royaume Uni, le Japon, la Corée, la Chine
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Dans le cadre de la coopération multilatérale L'IRESA participe à plusieurs projets, et programmes de recherche dans le cadre des programmes cadres de recherche développement financés par la communauté européenne en collaboration avec des équipes scientifiques, des deux rives sud et nord de la Méditerranée.
L'IRESA participe à plusieurs programmes de recherche développement régionaux et inter-regionaux en collaboration avec des organisations internationales :
CIHEAM :Le Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes
ACSAD : Arab Center for the Studies of Arid Zones and Dry Lands
OADA: l’organisation arabe du développement agricole
FAO: Organisation des nations unies pour l'alimentation et l'agriculture
AIEA: Agence Internationale de l'Énergie Atomique
ICARDA: International Center for Agricultural Research in the Dry Areas
FIDA: International Fund for Agricultural Development (IFAD)
AUF: Agence universitaire de la Francophonie
AFD: Agence Française de Développement
Biodiversity: Bioversity International
AAEA: Agricultural & Applied Economics Association
IRD: Institut de recherche pour le développement
COI :International Olive Council