تعنى الادارة الفرعية للتعاون الدولي بمؤسسة البحث والتعليم العالي الفلاحي بالاشراف على برامج التعاون العلمي الثنائي والمتعدد الأطراف للمؤسسة والمعاهد الراجعة لها بالنظر وكذلك التنسيق بين هذه البرامج.
يعتبر التعاون الدولي عنصر أساسي لدعم المنظومة الوطنية للبحث العلمي والتكنولوجيا وفي هذا الصدد تقوم مؤسسة البحث والتعليم العالي الفلاحي من خلال المؤسسات الراجعة لها بالنظر بإنجاز عدة مشاريع بحث والمشاركة في انجاز برامج بحث تنموي في إطار التعاون الثنائي والمتعدد الأطراف.
بالنسبة للتعاون الثنائي للمؤسسة علاقات تعاون متينة مع بلدان المغرب العربي (المغرب، ليبيا، الجزائر وموريتانيا) ومع مصر والأردن وسوريا والمملكة العربية السعودية وسلطنة عمان وفرنسا وإيطاليا وبلجيكيا وإسبانيا والبرتغال وتركيا واليونان وهولندا والسويد وسويسرا والولايات المتحدة الامريكية وكندا واليابان والصين وكوريا
أما في إطار التعاون المتعدد الأطراف تشارك مؤسسة البحث والتعليم العالي الفلاحي من خلال المؤسسات الراجعة لها بالنظر في طلبات العروض الخاصة بالبرنامج الاطاري للبحث والتنمية الممول من طرف الاتحاد الأوروبي وتقوم بانجاز عدة مشاريع بحث تنفد من قبل فرق بحثية تنتمي إلى ضفتي المتوسطي الشمالية والجنوبية وتشمل عدة مجالات تتعلق بأولويات الاتحاد والأولويات الوطنية
فوق
